Terminologie - Taxonomie du NCBI

Terminologie : Taxonomie du NCBI

Unité de production : NCBI
1. Description La NCBI Taxonomie est une classification phylogénétique de l’ensemble du règne du vivant servant de référence pour indexer les bases de séquences (génétiques, protéomique, etc.). La ressource est mise à jour quotidiennement en suivant les recommandations de comités internationaux de nomenclature. La version publiée sur le SMT propose un nettoyage automatique du règne Procaryote ne conservant que les taxons pertinents pour l’interopérabilité (exclusion des échantillon environnementaux, etc.) et enrichi avec des alignements vers d’autres référentiels tel que la CIM-11, le NCIT ou LOINC.
2. Version 2021-11 v1.0
3. Identifiant(s) 1.2.250.1.213.2.69.1
4. Champs sémantique Taxonomie
5. Usage Epidémiologie et santé publique, Annotation et intégration de données
6. Nombre de concepts 35 113
7. Domaine Organisme
8. Utilisateur(s) cible(s) médecin ou pharmacien biologiste, chercheur
9. Langue(s) ENG
10. Format(s) OWL
11. Site(s) de publication https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html/
12. Licence CC0 1.0
13. Pratiques de gestion Non
14. Accord de transfert Non
15. Publication 2022/07/15

Document(s) à télécharger

cgts_sem_ncbi_fiche-detaillee.pdf

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Mon, 18 Jul 2022 09:15:41 +0000

Nouvelle version de la terminologie Taxonomie du NCBI (2021-11 v1.0)

La Taxonomie du NCBI restreinte au règne des bactéries est maintenant disponible sur le SMT (2021-11 v1.0) :
  1. Une version ontologique en owl disponible par téléchargement.
  2. Une visualisation de la version courante avec un accès via les API et via l’endpoint SPARQL.